Huyện đã thành lập Ban chỉ đạo sản xuất nông lâm nghiệp trọng điểm giai đoạn 2006-2010 và ban hành các nghị quyết về chuyển dịch cơ cấu kinh tế, thực hiện các chương trình sản xuất nông nghiệp trọng điểm như: Đề án chăn nuôi thủy sản, đề án phát triển cây chè, dự án phát triển đàn bò lai, bò thịt chất lương cao, dự án phát triển cây lâm nghiệp... UBND huyện đã kiện toàn BCĐ SXNLN và phòng chống dịch bệnh nguy hiểm trên cây trồng, vật nuôi, phân công trách nhiệm cho từng thành viên phụ trách các xã, thị trấn trên địa bàn huyện, tận dụng nguồn vốn, các chương trình dự án WB, 135, VECO,... để nâng cao nhận thức, kiến thức KHKT cho nông dân góp phần cho sản xuất phát triển.

Năm 2006-2007, chương trình sản xuất lương thực trên địa bàn đạt tổng sản lượng 30.773,4 tấn. Một số giống lúa mới, ngô mới được đưa vào sản xuất, các giống lúa lai có năng suất chất lương cao như Syn 6, Thục Hưng 6 trồng thử nghiệm và đã có hiệu quả tốt để đưa vào nhân rộng diện tích trong các vụ tới... Đặc biệt là việc trồng, phục hồi giống lúa đặc sản nếp gà gáy đã thành công từ 2 ha trồng thử nghiệm tăng lên 46 ha ở năm 2007. Chương trình phát triển cây chè trong chiến lược phát triển kinh tế được coi trọng. 2 năm 2006-2007 diện tích chè cho sản lượng đạt cao, diện tích trồng mới đạt 150% KH. Riêng công tác quản lý nhà nước về cây giống được tăng cường, năm 2007 Yên Lập được tỉnh công nhận 4 vườn ươm cây giống với công suất 321,6 vạn hom để trồng vụ thu 2007 và vụ xuân 2008, tăng cường giám sát đánh giá việc thực hiện quy hoạch và bảo vệ rừng, thống kê, kiểm kê theo dõi diễn biến tài nguyên rừng...

Cũng từ việc ban hành đề án, dự án về phát triển chăn nuôi đàn bò thịt, lợn hướng nạc chất lượng cao và chăn nuôi gia cầm được triển khai rộng khắp trên toàn địa bàn. Các công tác điều tra quy hoạch, chọn hộ để đầu tư hỗ trợ giống vốn được tiến hành có quy mô, công tác chuyển giao tiến bộ kĩ thuật và khoa học công nghệ được chú trọng thực hiện nghiêm ngặt theo các giải pháp cơ bản: chọn giống, kỹ thuật chăm sóc, phòng chống dịch bệnh... Hiện nay tổng số đàn trâu bò trên địa bàn là 20.732 con ,trong đó 517 con bò cái lai sind, 17 bò đực giống lai sind đạt 117,8% kế hoạch , tổng đàn lợn 49417 con (không kể lợn sữa) bằng 105,5% kế hoạch là tiền đề cho sự phát triển nuôi gia súc gia cầm trong nhưng năm tới của huyện.

Để chương trình sản xuất nông lâm nghiệp trọng điểm và ứng dụng công nghệ sinh học nâng cao năng suất chất lượng sản phẩm cây trồng, vật nuôi góp phần thực hiện thắng lợi mục tiêu các chương trình sản xuất nông lâm nghiệp trọng điểm của huyện giai đoạn 2006- 2010, Ban chỉ đạo sản xuất nông lâm nghiệp huyện xây dựng kế hoạch triển khai thực hiện các nội dung trọng điểm, kế hoạch chi tiết hàng năm trình UBND huyện phê duyệt và tổ chức thực hiện theo. Chỉ đạo lồng ghép các chương trình dự án tập trung nguồn lực cho các chương trình, phối hợp với Đài truyền thanh huyện, xã giới thiệu các mô hình sản xuất nông lâm nghiệp trọng điểm có hiệu quả. Kinh nghiệm áp dụng khoa học công nghệ trong sản xuất, nhất là những sản phẩm mới, kiện toàn BCĐ sản xuất nông lâm nghiệp và bổ sung nhiệm vụ chỉ đạo thực hiện chương trình ứng dụng công nghệ sinh học tại các đơn vị; xây dựng kế hoạch triển khai thực hiện chương trình nông nghiệp trọng điểm và ưng dụng công nghệ sinh học sau khi được cấp có thẩm quyền phê duyệt; tổ chức triển khai nhân rộng các mô hình,tiến bộ kỹ thuật, công nghệ, các điển hình tiên tiến đã được khẳng định đưa ra sản xuất đại trà tại địa phương; Yêu cầu các tổ chức chính trị xã hội, các tổ chức cơ sở đảng có kế hoach, chương trình hành động, nghị quyết để chỉ đạo tổ chức triển khai thực hiện, đẩy mạnh công tác tuyên truyền vân động hội viên, đoàn viên của các tổ chức tích cực tham gia thực hiện. Đặc biệt huyện cũng có những kiến nghị đề xuất với các cấp các ngành của tỉnh tạo thêm nhiều điều kiện, các chính sách hỗ trợ ưu tiên, ưu đãi đối với huyện miền núi để huyện thực hiện các nhiêm vụ, mục tiêu có hiệu quả hơn.