Nghề trồng nấm, đặc biệt là nấm mèo (mộc nhĩ) có mặt ở thị xã Long Khánh hơn 20 năm nay với gần 400 hộ gia đình tham gia và hiện là nơi sản xuất nấm lớn nhất tỉnh Đồng Nai với sản lượng khoảng 30.000 tấn/ năm. Tuy nhiên, đến nay, vấn đề mà các hộ trồng nấm ở Long Khánh lo ngại nhất chính là đầu ra. Người sản xuất nấm trên địa bàn Long Khánh còn bị thiệt thòi về giá do không quan hệ được với các công ty hay đại lý tiêu thụ lớn, nấm được bán chủ yếu cho thương lái nhỏ tại địa phương nên giá vừa thấp và khả năng thanh toán cũng hạn chế. Sản phẩm nấm ở thị xã Long Khánh tiêu thụ còn bấp bênh là do chưa có thương hiệu, không tiếp cận được với những đơn vị trực tiếp xuất khẩu. Sản lượng nấm trong CLB khi cao điểm lên đến 140 tấn, nhưng chỉ cần rớt giá là mùa nấm sau sụt xuống chưa đầy 100 tấn. Người dân trồng nấm vẫn chạy theo thời giá. Thấy giá cao thì ồ ạt trồng, rồi lượng nấm bị ùn tắc kéo giá giảm xuống. Những người sản xuất nấm chuyên nghiệp ở thị xã cho rằng, để sản phẩm nơi đây có sức cạnh tranh hơn trên thị trường, đã đến lúc cần tổ chức sản xuất theo hướng tập trung và tạo dựng một thương hiệu nấm cho Long Khánh. Việc sản xuất nấm phải tổ chức theo quy mô lớn, tập trung và thống nhất như hợp tác xã (HTX) hoặc một doanh nghiệp mạnh, thì mới tạo ra sản phẩm đồng bộ, có sản lượng lớn để giao dịch với khách hàng. Để giao dịch xuất khẩu phải có sản lượng vài ngàn tấn trở lên. Hàng đi mua gom để xuất khẩu thì không ổn định, đôi khi sẽ gặp tình trạng lúc hàng nhiều lúc hàng ít, không thể chủ động để ký hợp đồng với khách hàng. Bên cạnh đó, chất lượng hàng hóa cũng không đảm bảo, do mỗi người sản xuất theo một cách khác nhau. Mô hình tốt nhất của việc sản xuất nấm hàng hóa hiện nay ở Long Khánh là tạo điều kiện thuận lợi cho doanh nghiệp đầu tư vào lĩnh vực này với tư cách là một "đầu tàu", vì khả năng quản lý của doanh nghiệp sẽ mang lại hiệu quả cao hơn. Hiện thị xã đã lập dự án phát triển nghề nuôi trồng nấm với quy mô lớn đến năm 2010 và cùng với một số doanh nghiệp triển khai dự án này và xúc tiến làm thủ tục đăng ký nhãn hiệu hàng hóa cho các loại nấm nơi đây.

Long Khánh hiện có gần 400 hộ làm nghề trồng nấm, trong đó có các loại như: nấm mèo, nấm rơm, nấm bào ngư và nấm sò, trong đó trại nấm nhỏ nhất có khoảng 40 thiên (mỗi thiên là 1.000 bịch mùn cưa trồng nấm) được đầu tư trên 100 triệu đồng; có không ít trại nấm có mức đầu tư hàng tỷ đồng. Các hộ trồng nấm nơi đây đã đầu tư cơ sở vật chất và kỹ thuật khá bài bản, với các dây chuyền tự động và bán tự động phục vụ sản xuất khá hiện đại và chuyên nghiệp. Vào mùa khô, khi hết vụ trồng nấm mèo (nấm mèo chỉ trồng từ tháng 5 đến tháng 11 hàng năm), người dân còn tận dụng nguồn mùn cưa thải từ nấm mèo để trồng thêm các loại nấm khác như: bào ngư, nấm rơm, nấm sò... để tăng thu nhập. Ước tính, trại nấm nhỏ nhất với 40.000 bịch nấm cho thu nhập từ 40 đến 50 triệu đồng/ năm, trong khi trại nấm lớn có thu nhập cả tỷ đồng/ năm sau khi trừ chi phí.