Sau khi kết thúc đợt 1 tiêm vacxin phòng bệnh cho đàn gia súc, gia cầm, từ trung tuần tháng 7 đến hết tuần đầu tháng 9, toàn tỉnh có 22 huyện, thị xã tổ chức tiêm vacxin phòng bệnh cúm gia cầm đợt 2 được 5.676.500 con vịt, 462.000 con ngan. Các huyện tổ chức tiêm phòng đạt tỷ lệ từ 85% tổng đàn nuôi trở lên như: Thọ Xuân, Yên Định, Thiệu Hóa, Hoằng Hóa... Các huyện Tĩnh Gia, Nga Sơn, Nông Cống, Quan Hóa và thành phố Thanh Hóa chưa tổ chức tiêm phòng đợt 2 cho  đàn gia cầm.

Để bảo vệ và phát triển đàn gia súc, đến thời điểm này đã có 24 huyện, thị xã (trừ Quan Hóa, Quan Sơn, thành phố Thanh Hóa chưa tổ chức tiêm) đã tiêm vacxin phòng bệnh lở mồm long móng cho đàn gia súc được 89.470 liều; tiêm vacxin tụ huyết trùng cho đàn trâu, bò được 153.450 liều; tiêm vacxin dịch tả lợn được 90.980 liều; tiêm vacxin tụ dấu lợn được 77.200 liều; vacxin phó thương hàn lợn được 1.300 liều và vacxin lép tô lợn 645 liều.

Hiện tại,  Chi cục Thú y tỉnh đang phối hợp với hệ thống  thú y cơ sở tiếp tục triển khai tiêm vacxin phòng, chống dịch bệnh cho gia súc, gia cầm ở những địa phương chưa thực hiện  tiêm phòng đợt 2, các địa phương khác tiếp tục tổ chức tiêm diện gia súc, gia cầm còn lại chưa tiêm đợt 2 năm 2007.