Trước đó, do tình hình nhập khẩu nguyên liệu cũng như thức ăn chăn nuôi bị ách tắc ở cảng vì còn phải chờ để làm thủ tục kiểm tra melamine, nhằm tạo điều kiện thuận lợi cho các doanh nghiệp nhập khẩu nguyên liệu cũng như thức ăn chăn nuôi, vào ngày 31-12-2008, Cục Chăn nuôi (Bộ NN-PTNT) đã có công văn gửi Tổng cục Hải quan và các phòng phân tích melamine trong nguyên liệu và thức ăn chăn nuôi trong cả nước, đề nghị lấy mẫu xác suất kiểm tra melamine của các loại nguyên liệu và thức ăn chăn nuôi nhập khẩu thuộc nhóm có nguy cơ nhiễm melamine như gluten các loại, bột cá, bột thịt, bột thịt xương, bột trứng, bột máu, sữa và các sản phẩm có chứa sữa từ 15% trở lên. Trong khi chờ kết quả phân tích, cho phép doanh nghiệp được làm thủ tục thông quan và niêm phong các lô hàng nhập khẩu.

Tuy nhiên sau đó, Tổng cục Hải quan lại cho rằng công văn 1492 của Bộ NN-PTNT “còn nhiều điểm trái với quy định của các văn bản hiện hành, do đó không thể thực hiện được”. Lý do là Luật Hải quan quy định công chức hải quan chỉ lấy mẫu để phục vụ quản lý hải quan chứ không có nhiệm vụ lấy mẫu để kiểm tra melamine của các loại nguyên liệu và thức ăn chăn nuôi nhập khẩu.