Theo PGS TS Phan Quốc Sủng - người nhiều năm dày công nghiên cứu về cây hồ tiêu, thì bệnh “Chết nhanh” còn gọi là bệnh chết yểu, bệnh chết đột tử (Sdent dend) thuộc bệnh nguy hiểm đối với loại cây này. Nguyên nhân gây bệnh do loại nấm Phytophthora thường có trong đất gây nên. Khi gốc cây hồ tiêu bị ngập nước thì nấm xâm nhập vào bộ rễ, huỹ hoại làm rễ thâm đen. Nước là tác nhân để nguồn bệnh di chuyển và xâm nhập huỷ hoại bộ rễ và lây lan bệnh làm cho cây chết nhanh. Biện pháp phòng trừ tốt nhất là chọn đất trồng hồ tiêu ở những nơi thoát nước tốt. Tuyệt đối không để cho cây hồ tiêu ngập nước trong mùa mưa.
Đối với cây hồ tiêu thường bị các loại bệnh về lá, làm cho cây giảm năng suất và chết dần chết mòn. Trong đó có “Bệnh vàng lá chết chậm” (còn gọi là bệnh tiêu sầu) do một số loại tuyến trùng Meloidogyne incognita gây nên nốt sần sưng u ở trên rễ, ngăn cản quá trình hút nước và các chất dinh dưỡng cây hồ tiêu. Để phòng trừ bệnh, trong canh tác phải bón đủ phân hữu cơ. Cứ 2-3 năm, bón phân hữu cơ 1 lần, đồng thời tủ gốc hồ tiêu bằng tàn dư thực vật như rơm rạ, vỏ cà phê, vỏ đậu lạc, thân cây đậu đỗ. Có thể trồng cây hoa cúc vạn thọ giữa 2 hàng hoặc xung quanh gốc hồ tiêu. Khi cúc ra hoa, thì chặt cây, băm nhỏ vùi vào lớp đất ở tầng mặt của gốc hồ tiêu để diệt tuyến trùng ở trong đất.
Cây hồ tiêu cũng bị bệnh vàng lá do những loại nấm Fusarium spp, Pythium spp, Phytophthora spp, Rhijoctonia spp. Khi cây có vết thương do rệp sáp hút nhựa, hoặc khi xới xáo gốc bón phân gây nên thì các loại nấm này xâm nhập bộ rễ gây bệnh hại hồ tiêu. Biện pháp phòng ngừa bệnh này là không tạo vết thương ở rễ hồ tiêu, đặc biệt là giai đoạn mùa mưa, đất có độ ẩm cao. Vì vậy, phòng trừ bệnh tốt nhất vào đầu mùa mưa và bón phân hoá học bằng xăm một lớp đất mặt mỏng để không hại rễ; đồng thời thực hiện biện pháp tủ gốc dày để giữ ẩm nhằm hạn chế sự mất nước dễ làm cây hồ tiêu vàng héo.
Trong quá trình canh tác thường gặp rệp sáp (Pseudococcus) gây hại hồ tiêu. Khi rệp sáp xâm nhập huỷ hoại bộ rễ, làm cho hồ tiêu bị chết dần. Do vậy, khi trồng mới hồ tiêu phải xử lý mầm bệnh rệp sáp triệt để trước khi trồng. Khi cây phát triển phải thường xuyên theo dõi sự xuất hiện rệp sáp để kịp thời phòng trừ.
Cây hồ tiêu cũng thường bị bệnh xoăn, khảm lá do vius làm cho cây cằn cỗi kém phát triển. Nếu phát hiện cây bị bệnh, phải cắt huỷ cây rồi đưa đi đốt. Trong quá trình chăm bón, nếu phát hiện loại bệnh này, cần phun thuốc diệt trừ các loại bọ rầy, rệp trong vườn hồ tiêu để loại bỏ tác nhân làm lây lan bệnh từ cây này sang cây khác...