Đề án tập trung vào các nội dung gồm: tạo giống thủy sản và bảo tồn khai thác nguồn gien; nghiên cứu thức ăn, phòng trị bệnh và quản lý môi trường thủy sản; chế biến quản lý chất lượng; phát triển công nghệ công nghiệp sinh học thủy sản; nâng cao nguồn nhân lực và tăng cường trang thiết bị, phòng thí nghiệm, đồng thời đẩy mạnh hợp tác quốc tế, xây dựng cơ sở pháp lý, công tác thông tin tuyên truyền và quản lý điều hành đề án.