Mặc dù Nga là thị trường xuất khẩu có mức tăng trưởng đột biến trong năm 2008 nhưng sang năm 2009, nhiều chuyên gia ngành Thủy sản nhận định: xuất khẩu sang thị trường này sẽ gặp nhiều khó khăn. Nguyên nhân chính là do, bắt đầu từ quý I-2009, Cục Kiểm dịch động, thực vật Liên bang Nga (VPSS) đã ban hành lệnh cấm đối với các doanh nghiệp thủy sản Việt Nam kể từ ngày 20-12-2008.
Tuy nhiên, để đẩy mạnh kim ngạch xuất khẩu thủy sản vào thị trường này, Bộ Nông nghiệp và Phát triển Nông thôn đang tăng cường kiểm soát chất lượng, an toàn vệ sinh thực phẩm thủy sản xuất khẩu vào Liên bang Nga đối với các cơ sở chế biến thủy sản và hàng hóa thủy sản. Bộ sẽ ưu tiên đưa danh sách các cơ sở chế biến thủy sản đông lạnh có hợp đồng với nhà nhập khẩu Liên bang Nga, khi các sản phẩm đáp ứng đủ các điều kiện nêu trên và được VPSS kiểm tra, công nhận.
Cục Quản lý Chất lượng và Thú y Thủy sản cho rằng, năm 2008, Nga đã thực sự trở thành những thị trường có bước tăng trưởng đột phá, tăng 82,9% về giá trị và vượt lên đứng thứ 3 về nhập khẩu thủy sản Việt Nam (sau EU và Nhật Bản). Nga sẽ vẫn là thị trường xuất khẩu tiềm năng của thủy sản Việt Nam trong năm 2009.